معمولا در حیاط امام زاده ها تک درخت یا درختان قدیمی وجود دارد که زیر آن در متراژ سه گز می تواند محل دفینه باشد.
از مکان های دیگر در سقف امامزاده ها از مکانهای مخفی سازی بود.
اکثر افرادی که به اسم امام زاده ها دفن شدند از سرداران جنگی اعراب بودند که با لباس و تجهیزات جنگی دفن می شد.
اما دفینه اصلی که خرج امامزاده بود در زیر کفش کن در متراژ 70 سانتیمتری قرار می گرفت
و بعضی از مردم نیز نذر خود را به خادم امامزاده می سپردند و خادم هم آنها را جمع آوری می کرد.
مقداری را خرج امامزاده می کرد و مابقی اشیاء با ارزش را در پشت امامزاده با به وجود آوردن تلی از خاک در زیر زمین (تل) دفن می کرد.
زمانی که به داخل حیاط بیشتر امامزاده ها بروید قسمتی به صورت تل وجود دارد و یا حتی امکان دارد که خود امامزاده را روی خود تل بنا کرده باشند.
یکی دیگر از مکان های مهم دفینه در امام زاده ها کف طاقچه امام زاده ها بوده است .